Virus iz familije Flaviviridae (genus Flavivirus). Postoje dva podtipa virusa evropski podtip (srednjeevropski krpeljski meningoencefalitis) i dalekoistočni podtip (ruski prolećno letnji krpeljski meningoencefalitis). Virus je prisutan i na našim prostorima, prvenstveno u alpskim predelima Slovenije i u zapadnoj Hrvatskoj.
Virus se prenosi vektorima i to: krpeljom Ixodes ricinus i Dermacentor pictus.
Rezervoar ovog virusa su divlji glodari.
Patogeneza bolesti
Manifestacija bolesti je dvofaznog toka. Prva faza slična je influenci. Druga faza je praćena povišenom temperaturom, znaci aseptičnog meningitisa, meningoencefalitisa ili encefalitisa. Subkliničke infekcije su česte. Teški oblici oboljenja su retki.